2019年，科技部、財政部聯合發布了國家科技資源共享服務平臺優化調整名單，依托國家水產種質資源共享服務平臺建設的國家淡水水產種質資源庫和國家海洋水產種質資源庫獲批建設。其中，國家淡水水產種質資源庫依托中國水產科學研究院牽頭組建，國家海洋水產種質資源庫依托中國水產科學研究院黃海水產研究所牽頭組建。
2019年年底國家淡水水產種質資源庫和國家海洋水產種質資源庫按照《國家科技資源共享服務平臺管理辦法》提出的各國家科技資源共享服務平臺應按照相關標準建成科技資源在線服務系統的要求著手設計建設兩大資源庫的在線服務系統。目前，兩大資源庫的在線服務系統均已按照《國家科技資源共享服務平臺在線服務系統建設運行管理規范》完成相關建設并已在院內網上線運行，此為兩大資源庫唯一的在線服務系統。
國家淡水、國家海洋兩大水產種質資源庫在線服務系統涵蓋平臺概況、新聞動態、種質資源、平臺服務、國際合作、媒體資源、標準規范、規章制度和關于我們等內容欄目，較之前在線服務系統相比涵蓋內容更加完善，支持物種資源的高級檢索、智能排序，同時突出了種質資源、平臺服務、國際合作等近幾年平臺的主體工作，圍繞兩大資源庫的特點設計了全新的logo和視覺系統，并與中國科技資源共享網實現了有效的對接和互聯互通。后期我們會建立健全信息管理、安全管理、應急響應等制度，及時開展系統升級與完善，確保在線服務系統安全穩定運行，提高科技資源利用效率，提升兩大資源庫的運行服務水平。
